Yeni Deneyler Oluşturma

CytExpert yazılımı, renk telafisini ve örnek edinimi deneylerini sırasıyla .xitc ve .xit olarak belirlenen ayrı dosyalara ayırır. Deneyi yapan kişi, ilk olarak hangisini gerçekleştireceğini seçebilir.

Yeni Deneyler Oluşturma (.xit)

  1. File (Dosya) menüsünde New Experiment (Yeni Deney) öğesini seçin, dosya yolunu belirtin ve deneyi adlandırın veya Exp_YYYAAGG-1 olarak varsayılan dosya adını kabul edin ve Save (Kaydet) öğesini seçin.
  2. Settings (Ayarlar) menüsünde Set Channel (Kanalı Ayarla) öğesini seçin. Onay kutusunda istediğiniz kanal sinyallerini seçin. İstenirse etiket sütununa reaktif adını yazın.
  3. Deney çalışma alanında diyagramlar oluşturmak için araç çubuğu butonlarını keşfedin. Gösterilen kanalı değiştirmek için grafik üzerinde bir eksen adı seçin.
  4. Geçitler oluşturmak için, araç çubuğundaki geçitleme kontrol düğmelerini kullanın veya diyagrama sağ tıklayın ve gerekli geçit türünü seçin.
  5. Geçitleri gerekli diyagramlara atamak için diyagramın başlık alanını seçin.
  6. Popülasyon hiyerarşisini görüntülemek için araç çubuğundan Population Hierarchy (Popülasyon Hiyerarşisi) butonunu seçin. Popülasyon hiyerarşisi penceresinde renk veya ada çift tıklayarak geçitlerin renk ve adlarını değiştirebilirsiniz.
  7. İstatistikler penceresini görüntülemek için araç çubuğu için Statistics (İstatistikler) butonunu seçin. Statistics (İstatistikler) tablosuna sağ tıklayın ve Statistics Setting (İstatistik Ayarı) öğesini seçin ve istenen başlığı, istatistikleri ve ilgilenilen popülasyonları kontrol edin.
  8. Acq. Setting (Edinme Ayarı) penceresini açmak ve sitometre kazançlarını ve eşik ayarlarını görüntülemek için, sol taraftaki panelde yer alan Acq. Setting (Edinme Ayarı) butonunu seçin. Gain (Kazanç) sekmesinde, kendi varsayılan parametre kazanç ayarlarınızı belirtmediğiniz durumlarda Recommended (Önerilen) seçeneğini seçin.
  9. Telafi matrisi tablosunu açmak için Settings (Ayarlar) menüsünden Compensation Matrix (Telafi Matrisi) öğesini seçerek gerekirse telafi değerlerini deneye uygulamak üzere telafi matrisini içe aktarın. Import From Library (Kütüphaneden İçe Aktar) veya Import (İçe Aktar) seçeneğini seçin ve içe aktarılacak telafi matrisi dosyasını (.comp) bulun. Telafi matrisi ve kazanç ayarlarını içe aktarmak için istenen seçeneği seçin. Daha fazla bilgi için Cytoflex IFU Telafi modülünde Telafiyi İçe ve Dışa Aktarma kısmına başvurun.

Örnek Alımı ve Veri Toplama

  1. Örnek tüpünü örnek tüpü tutucusuna yerleştirin ve örneği yüklemek için Run (Çalıştır) öğesini seçin. Acquisition (Edinim) panelinde, örnek akış hızını seçin ve Görüntülenecek Olaylar, Kaydedilecek Olaylar ve Kaydedilecek Süre için istenen edinim ayarlarını yazın.
  2. Acq. Setting (Edinim Ayarı) penceresinde Gain (Kazanç) sekmesindeki farklı kanallar için kazanç ayarlarını ayarlayın veya veri toplama sırasında verilerin görüntülendiği diyagram üzerinde doğrudan araç çubuğundaki Gain Control (Kazanç Kontrolü) düğmesini kullanın. Kazanç artırıldığında, sinyal yükselir. Kazanç düşürüldüğünde, sinyal azalır.
    Not: Kazanç ayarlarını kendi deney hedeflerinize göre optimize edin. Önerilen ayarlar yalnızca referans amaçlıdır.
  3. Gereksiz sinyal parazitini kaldırmak için gerekiyorsa, Acq. Setting (Edinim Ayarı) penceresinden Threshold (Eşik) sekmesini seçerek eşik ayarlarını oluşturun. Eşik ayarı için kanalı seçin ve Threshold (Eşik) sekmesine manuel olarak bir değer girin. Alternatif olarak, araç çubuğundan Threshold (Eşik) düğmesini seçin ve fareyi istenen diyagramda istenen eşik konumuna getirin.
  4. Verileri kaydetmek için Record (Kaydet) öğesini seçin ve kaydetme işleminin bitmesini bekleyin. Örnek tüpü tutucu, örnek yükleme pozisyonuna döner. Gerekirse Tube (Tüp) listesine ek tüpler ekleyin, tüpleri yükleyin ve gerekli tüm veriler toplanana kadar her tüp için verileri kaydedin.

Deneyle Dışa Aktarılacak İstatistikleri Belirleyin

İstatistikler tablosu, Workspace (Çalışma Alanı) sekmesinden “Statistic” (İstatistik) simgesi seçilerek oluşturulabilir.

  1. İstatistik tablosu açıldığında, menüye erişmek için tabloya sağ tıklayın.
  2. Statistics Settings (İstatistik Ayarları) seçeneğini seçin ve burada görüntülemek istediğiniz istatistikleri, popülasyonu ve başlığı seçin.
  3. Tüm örneklere uygulamak istiyorsanız Statistic Setting (İstatistik Ayarı) penceresinin alt kısmındaki Apply to All Tubes (Tüm Tüplere Uygula) öğesini seçin. Tamamlandığında OK (Tamam) öğesini seçin.
  4. İstatistikleri bir csv tablosuna dışa aktarmak istiyorsanız tabloya sağ tıklayın ve Export All Samples to CSV File (Tüm Örnekleri CSV Dosyasına Dışa Aktar) öğesini seçin. Dizini seçin ve dosyayı kaydedin.
  5. Bu dosyayı Excel'de açabilir ve ayrıca bir .xls dosyası olarak kaydedebilirsiniz.

Veri Analizi

  1. Mevcut bir deneyi açın (.xit)
    File Menu > Select FCS File, Open. (Dosya Menüsü > FCS Dosyası Seç, Aç) İçe aktarılan dosyaların artık yeşil bir dairesi vardır.
  2. Ekranın sol tarafındaki analiz simgesini seçin
  3. Analizi tamamlamak için grafik oluşturma araçlarını gerektiği şekilde kullanın. Çoklu veri veya katmanlı diyagramlar (aşağı açılan menü). Katmanları doldurmak için elmas şekilli aracı seçin veya dosyaları sürükleyip bırakın.

Daha ayrıntılı kullanım talimatları için veri analizine yönelik kullanıcı kılavuzu talimatlarına bakın.

CytoFLEX Başlatma Kılavuzu