Günümüzde herkesin birbirine bağlı olduğu dünyamızda son teknolojiyi kullanmaya devam eden Cytobank platformunun bulut tabanlı özellikleri, dünyanın dört bir yanındaki bilim insanlarının büyük ve karmaşık veri kümelerini daha derinlemesine incelemelerine ve iş birliği yapmalarına olanak tanır. Cytobank platformu, akış ve kütle sitometresi verilerinizi web üzerinde yönetme, analiz etme ve paylaşmanın bir yolunu sunar. Bu, farklı kullanıcı gruplarının verilere erişim düzeylerinin farklılaştırılması gerektiği günümüzün çok merkezli ve çok disiplinli iş birliklerinde önemli bir ihtiyaçtır.

Verilerin Düzenli Tutulması

Akış analizi sırasında yaygın bir sorun, dozlar, bileşikler, zaman noktaları ve diğer deneysel değişkenler gibi deney ayrıntılarının takip edilmesidir. Cytobank analiz sistemi, kullanıcıların Örnek Etiketleri kullanarak şekillerini döndürmelerine, filtrelemelerine ve düzenlemelerine olanak tanıyacak şekilde tasarlanmıştır. Ne kadar fazla ayrıntı verilirse, kullanıcının şekil düzenleme ve yönlendirme konusunda o kadar fazla esnekliği olur. Kullanıcılar artık, 1 ng/ml dozunun hangi FCS dosyasına karşılık geldiğini hatırlamaya çalışmak yerine, hangi popülasyonların doz artışına yanıt verdiği veya hangi örneklerin düşük T hücre sayısına sahip olduğu gibi sorulara odaklanabilir. Her deney ayrıca eklentiler de içerebilir (Adobe PDF ve PowerPoint belgeleri ve Excel elektronik tabloları gibi). Kullanıcılar deneylerini düzenlemek ve arama yapmak için e-posta benzeri bir arayüze (Deney Yöneticisi) sahiptir. Ek olarak, makine öğrenimi destekli analiz için algoritma ayarları otomatik olarak saklanır, bu da deneysel tekrarlanabilirliği destekleyen önemli bir özelliktir. 
Deney Özeti sayfası, Deneyiniz hakkında bilgi almak için bir entegrasyon noktasıdır. Deney hakkında aşağıdaki gibi ayrıntıları ve bilgileri içerir:

• Amaç, yorumlar ve proje üyeliği

• Kaydedilen şekiller (illüstrasyonlar)

• Yüklenen ve dışa aktarılan ekler

• Protokoller

• Deneydeki FCS dosyalarının listesi ve ilgili meta veriler

İlgili deneyler artık birlikte gruplandırılmıştır ve ilişkileri bir “aile ağacında” görselleştirilmiştir. Artık deneyleri doğrudan Deney Yöneticisi üzerinden paylaşabilir ve yeniden adlandırabilir, görüntülenecek sütunları özelleştirebilir, gizleyebilir veya 'sık kullanılan' filtreleri oluşturabilir ve yeni Birincil Araştırmacı filtrelerini kullanarak iş birliği yapanların ve grup üyelerinin neler yaptığını (izin verdikleri yerlerde) hızlıca görebilirsiniz.

Buluta veri yüklemek, ayrıca araştırma gruplarında dosyaları yönetmek için uygun bir yol da sağlar – PI’lar veya grup yöneticileri, özellikle bu üyeler yeni pozisyonlara geçiş yaparken FCS dosyalarını ve üyelerin dizüstü bilgisayarlarında bulunan analizlerini takip etmek zorunda kalmayı önleyebilir.

Verilerinizin kopyalarını Cytobank üzerinde depolamanın bir başka avantajı da veritabanımızın düzenli olarak yedeklenmesidir. Bilgisayarınız (FCS dosyalarınızı ve analizlerinizi içeren) aniden arızalanırsa, bu dosyalara ve analizlere Cytobank üzerinden kolayca erişebilir ve kurtarabilirsiniz.

Paylaşma ve Erişimi Kontrol Etme

Cytobank’ta (dünyanın herhangi bir yerinde bulunan) başka bir kullanıcıyla bir deneyi paylaşmak, paylaşmak istediğiniz önemli ayrıntıların herhangi birini görünür hale getirir. Buluttaki veriler ve analizler sayesinde, artık iş arkadaşlarınızla paylaşabileceklerinizde zaman veya alan sınırlaması olmaz. Yapmaları gereken tek şey buluta erişmek ve ham veriler, nihai görüntüler veya aradaki bir şey de olabilen ihtiyaç duydukları ayrıntıları aramaktır.

Cytobank platformunda Deneyler, organizasyonel amaçlar için ve bir grup insan arasında Deneylere erişimin paylaşılması için Projeler olarak gruplanabilir. Bu, farklı kullanıcı gruplarının verilere erişim düzeylerinin farklılaştırılması gerektiği günümüzün çok merkezli ve çok disiplinli iş birliklerinde önemli bir ihtiyaçtır.

• Proje içindeki kişileri organize etmek için proje görevlerini kullanın
• Üyelerin verilerle neler yapabileceğini kontrol edin
• Projelere deney ekleme ve çıkarma

Küresel Ölçekte İş Birliği Yapın

Bir deneyle birlikte uygun deney ayrıntıları sağlanmazsa sonuçların iletilmesi faydalı olmaz. Cytobank platformunda, veri kümeleri analiz sırasında kritik deneysel ayrıntılarla tam olarak açıklanır ve bu ayrıntıları dünya genelindeki iş birlik yaptığınız taraflarla paylaşmak birkaç tık uzaklıktadır.

Kullanıcılar ayrıca Cytobank’taki diğer kullanıcılarla deneylerini paylaşabilirler. Bunu web tarayıcısı ve İnternet bağlantısı olan herhangi bir bilgisayardan yapabilme imkanı, sitometre verileriniz için merkezileştirilmiş ve yedeklenmiş depolamayı içeren ve FCS dosyaları ile E-posta gelen kutunuzu doldurma ihtiyacını ortadan kaldıran birçok avantaja sahiptir. Ayrıca deneyler aranabilir ve ayrıştırılabilir ve paylaşım deney başına veya deney toplamaları (projeler) aracılığıyla yönetilebilir.

Çalışma arkadaşları deney sonuçlarıyla başlayabilir, temel ham verilere ulaşabilir ve laboratuvar arkadaşları, çalışma arkadaşları ve bilimsel topluluktaki diğer kişilerle paylaşımı ve tartışmayı kolaylaştırabilir. Kullanıcılar, akış sitometre verilerini analiz edebilir ve ısı haritaları ve histogram katmanları gibi toplu görselleştirmeler ve SPADE, FlowSOM, viSNE ve CITRUS gibi gelişmiş görselleştirme ve boyut azaltma algoritmaları aracılığıyla standart akış sitometresi grafiklerini kullanarak sonuçları görsel hale getirebilirler.