Kaluza ile Başlarken: Dosyaları Yükleme ve Diyagram Oluşturma
Burada, Kaluza*’da Akış Sitometresi Standardı (FCS) dosyalarını nasıl açacağınızı ve histogramlar ve iki eksenli diyagramlar gibi temel diyagram türlerini kullanarak kendi geçit oluşturma hiyerarşinizi nasıl oluşturmaya başlayacağınızı göstereceğiz. Özellikler ve işlevler hakkında ayrıntılı açıklamalar için lütfen Kullanım Talimatlarına (IFU) bakın. Bu video, IFU'nun yerini almaz.
Dosyaları Yükleme
Dosyaları Kaluza Analysis yazılımına aktarmanın birden fazla yolu vardır. Tercih edilen yöntem, Hoş Geldiniz Ekranından veya halihazırda yazılımda çalışırken yapılabilecek olup aşağıdaki talimatlarda açıklanmıştır. Burada sunulan seçeneğin yanı sıra ek seçenekler de Kaluza Analysis Instructions for Use (Kaluza Analysis Kullanım Talimatları) içinde ayrıntılı olarak açıklanmaktadır. Kaluza Analysis, 3.1 sürümüne kadar FCS standardıyla uyumlu olan tüm liste modu dosyalarını yükleyebilir.
- Analiz etmek istediğiniz dosyaları bulun.
- Dosyaları seçin ve Kaluza Analysis Listesine sürükleyin ve fare düğmesini bırakın. Varsayılan olarak, orijinal dosya adları Analysis List (Analiz Listesi) Data Set (Veri Kümesi) sütununda görünür.
Basit Diyagramlar ve Geçitler Oluşturma
Bu sunum için veriler DURAClone IM Phenotyping Basic Antikor Paneli ile boyanmış, CytoFLEX LX akış sitometresinde elde edilmiş ve Kaluza Analysis Yazılımı ile analiz edilmiş normal tam kan örneği kullanılarak oluşturulmuştur.
Basit Diyagramlar Oluşturma
Kaluza Analysis, Protokol seçiminizi özelleştirmeniz için her biri veri sunumu için özelleştirilebilen bir çok diyagram ve tablo türü sunmaktadır. İki eksenli nokta diyagramları ve histogram diyagramları ekleme ve yapılandırma talimatları aşağıda verilmiştir. Daha ayrıntılı talimatlar ve diğer diyagram türleri için talimatlar için lütfen Kaluza Analysis Yazılımı Kullanım Talimatlarına bakın.
- Bir diyagram eklemek için, Plots & Tables (Diyagramlar ve Tablolar) şerit sekmesini seçin. Diyagramı analizin alt kısmına eklemek için nokta grafiği veya histograma karşılık gelen simgeyi seçin. Sayfada belirli bir konuma diyagram eklemek için, nokta diyagramı veya historgram için simgeye tıklayın, tercih ettiğiniz konuma sürükleyin ve fare butonunu serbest bırakın.
(Parametre seç) hiperlinkini, diyagramın X veya Y Ekseninden seçin ve listeden görüntülemek istediğiniz parametreyi seçin. - Parametreleri seçerek histogramdan iki eksenli diyagrama veya tam tersi yönde geçiş yapmak da mümkündür.
- Bir diyagramla ilişkili renklendirmeyi güncellemek için Radyal Menü’ye erişim sağlayın ve Renklendirme öğesini seçin. Bu, örneğin geçit ve yoğunluk renklendirmesi arasında geçiş yapmanızı ve Contour (Kontur) ve Density (Yoğunluk) diyagramlarındaki bantların rengini değiştirmenizi sağlar.


NOT: varsayılan olarak parametre listesi fcs dosyasında bulunan tüm parametreleri (64 adede kadar) içerecektir. Veri analiziniz için gerekli olmayan parametrelerin nasıl boşaltılacağını öğrenmek için Kaluza Analysis Kullanım Talimatları içerisinde Yüklenen Parametreleri Düzenleme bölümüne bakın. Bir diyagramda veriler eksik görünüyorsa veya sadece az sayıda olay görünüyorsa, Radial Menu > (Data) (Radyal Menü > (Veri)) öğesine erişerek görüntülenen dekat sayısını veya Display Min/Max (Min./Maks. Görüntüleme) veya Auto (Otomatik) seçeneklerini ayarlayın. Görüntülenecek diyagram alanını seçmek için Geçitler ve Araçlar şerit sekmesindeki Yakınlaştırma araçlarını da kullanabilirsiniz.

Temel Geçitler Oluşturma
Geçit, daha fazla inceleme amaçlı kullanılacak olayların bir alt kümesini tanımlamak için kullanılır. Kaluza Analysis, ek analiz için olayların tam kümesini tanımlamanızı sağlayan birçok geçit türü sağlamaktadır. Çokgen Geçitlerin kullanımı aşağıdaki bölümde açıklanmaktadır. Çokgen geçit, 128’e kadar nokta içeren bir geçit oluşturmanızı sağlar; bu seçenek, geçidinize dahil edilmek üzere çok spesifik bir olay bölgesi belirlemenizi sağlar. Polygon (Poligon) geçit, Dot, Density, Contour ve Radar (Nokta, Yoğunluk, Kontur ve Radar) diyagramlarında kullanılabilir.
- Gates & Tools (Geçitler ve Araçlar) şerit sekmesinden Polygon [Poligon] simgesini seçin.
- Farenizle geçidinizi oluşturmaya başlamak istediğiniz yere tıklayın.
- Geçidiniz için gerekli olan yolu belirleyin ve farenizle, her bir yön değişimi konumuna tıklamaya devam edin. Geçidi çizerken, farenizle her tıkladığınızda yeni bir çizgi eklenir ve varsayılan geçit rengi görüntülenerek ilerlemenizi gösteren bir kılavuz görevi görür.
- Geçit tamamlandığında çift tıklayın veya ilk noktayı seçin.

NOT: Köşe noktası eklemek için farenizi köşe noktası eklemek istediğiniz alanda hareket ettirebilirsiniz. Fare imleci bir el sembolüne dönüştüğünde tıklayın ve dışa doğru sürükleyin. Bir köşe noktasını silmek için, (Ctrl) tuşuna basın ve silinecek noktaya tıklayın.

Geçitleri Diyagramlara Uygulama
- Seçenek: Hiperlinki kullanarak bir diyagramda geçit oluşturmak için, diyagramın üst kısmında bulunan hiperlinki seçin. Açılır menüden istediğiniz geçidi seçin.
- Seçenek: Bir diyagramı sürükle/bırak yöntemini kullanarak geçitlemek için, Alt tuşuna basın ve basılıyken diyagram için giriş geçidi olarak kullanmak istediğiniz geçidi seçin. Geçidi diyagram üzerine sürükleyin ve işlemi tamamlamak için fare düğmesini ve Alt tuşunu bırakın.
Kaluza Analysis Yazılımı Yalnızca Araştırma Amaçlı Kullanım İçindir. Tanılama prosedürlerinde kullanmak için uygun değildir
