FlowSOM, tüm hücrelerde işaretleyici ekspresyonunun genel bir değerlendirmesini sağlamak ve manuel geçitleme ile gözden kaçabilecek hücre alt kümelerini ortaya çıkarmak için kendi kendini düzenleyen haritalar oluşturan güçlü bir kümeleme algoritmasıdır 1. Tek bir hücre analizi iş akışında birçok noktada uygulanabilir: manuel geçitlemeden önce, sonra ve hatta geçitleme yerine. FlowSOM'un sonuçları hızlı bir şekilde ürettiği ve hücre kümelerini otomatik olarak daha yüksek sıralı meta kümeler halinde gruplandırdığı gösterilmiştir. Bu video, Cytobank platformunda FlowSOM'un neden ve nasıl çalıştırılacağını ve sonuçların nasıl yorumlanacağını açıklamaktadır.
Daha fazla ayrıntı ve talimat için Cytobank Destek sayfalarımızı da ziyaret edin.
Referanslar
-
Van Gassen S, Callebaut B, Van Helden MJ, et al. FlowSOM: Using self-organizing maps for visualization and interpretation of cytometry data: FlowSOM. [Sitometre verilerinin görselleştirilmesi ve yorumlanması için kendi kendini düzenleyen haritaların kullanılması: FlowSOM] Cytometry. 2015;87(7):636-645. doi:10.1002/cyto.a.22625